哈佛大学的科学家公布了一项名为扩展原位基因组测序 (ExIGS) 的新技术，该技术将现有的原位基因组测序 (IGS) 与扩展显微镜 (ExM) 相结合。这项创新技术使研究人员能够通过纳米级 DNA-蛋白质相互作用的精确测量，将细胞核异常与单个细胞内的基因调控改变联系起来。
显微镜是表征细胞功能的重要工具。成像方法受到光学显微镜衍射极限的限制，无法在 DNA-蛋白质相互作用的尺度上进行可靠的测量。
膨胀显微镜是一种巧妙的技术，它通过放大物体来克服因衍射极限而无法看到物体的问题。通过将样品嵌入可膨胀的聚合物凝胶中并将其膨胀，研究人员可以使用传统显微镜对细胞内的空间组织进行超分辨率成像。
在 ExIGS 中，扩展显微镜与原位基因组测序相结合，以同时对单细胞内的基因组 DNA 进行测序并以纳米级分辨率对核蛋白进行成像。
该过程首先将固定细胞嵌入聚丙烯酸酯凝胶中，作为扩增的支架。基因组 DNA 和蛋白质通过 DNA 寡核苷酸钩与凝胶化学连接，DNA 寡核苷酸钩与附着在基因组片段和蛋白质上的 DNA 发夹结合。这些钩含有在聚合过程中与凝胶形成共价键的化学基团。
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